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T-RACING: Applicazione a supporto della ricerca epidemiologica delle malattie nella produzione animale in Italia

Dall'Istituto Zooprofilattico di Teramo lo studio su malattie bovine. Un aiuto anche per la lotta alla Peste Suina Africana in Italia?... Il sistema a breve sarà incorporato a VETINFO...

5 Giugno 2025
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L'approccio One Health unisce gli sforzi tra le interfacce uomo-animale-ambiente contro minacce condivise come le malattie zoonotiche. T-Racing è un'applicazione web Shiny che supporta le indagini epidemiologiche e contribuisce a contenere la diffusione di malattie legate al bestiame, allineandosi ai principi multidisciplinari per la tutela della salute pubblica.

Materiali e Metodi: L'applicazione utilizza tecniche di analisi di rete temporale per affrontare la natura dinamica del commercio di animali, facilitando strategie di tracciamento a ritroso e in avanti. T-Racing sfrutta i servizi web per recuperare dati da più fonti simultaneamente e quasi in tempo reale tramite il pacchetto Plumber e viene distribuito tramite Shinyproxy. T-Racing gestisce e analizza set di dati estesi e diversificati all'interno dello stesso ambiente, inclusi dati sugli spostamenti degli animali, dati sulle epidemie e dati genomici, tutti ottenuti da database nazionali italiani. In questo lavoro, mostriamo le capacità di T-Racing simulando indagini epidemiologiche su epidemie di brucellosi e tubercolosi verificatesi in aree non endemiche d'Italia. Per evidenziare ulteriormente le sue capacità, è disponibile una demo interattiva di T-Racing che ne mostra il potenziale e le funzionalità.

Fig. 1. Frammentazione e aggregazione della rete nei registri di movimentazione degli animali. Il pannello in alto a destra mostra come più allevatori della stessa azienda siano rappresentati come nodi diversi, il che porta a una frammentazione artificiale. Il pannello in basso a destra illustra il processo di aggregazione, in cui ogni nodo rappresenta l'azienda fisica, che comprende più proprietari a livello fiscale.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313.g001
Fig. 1. Frammentazione e aggregazione della rete nei registri di movimentazione degli animali. Il pannello in alto a destra mostra come più allevatori della stessa azienda siano rappresentati come nodi diversi, il che porta a una frammentazione artificiale. Il pannello in basso a destra illustra il processo di aggregazione, in cui ogni nodo rappresenta l'azienda fisica, che comprende più proprietari a livello fiscale. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313.g001

Risultati: Questo strumento supporta le indagini epidemiologiche adottando un approccio basato sui dati, guidando gli utenti attraverso l'analisi, attraverso un processo iterativo e sfruttando al contempo la loro competenza.

Conclusioni: Consente un'analisi dei dati più rapida, migliora la comprensione dei modelli di trasmissione delle malattie e facilita interventi tempestivi e mirati...

Figura 3. Mappa concettuale di T-Racing.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313.g003
Figura 3. Mappa concettuale di T-Racing. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313.g003

Candeloro, L., Savini, L., Conte, A., Calistri, P., Palma, D., Perticara, S., ... & De Massis, F. (2025). T-Racing: a modern tool for supporting epidemiological investigation in animal disease outbreaks in Italy. PloS one, 20(2), e0317313.https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317313

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