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Il PRRSV Variants Under Monitoring (VUMs) Monthly Report, in collaborazione con il Morrison Swine Health Monitoring Project (MSHMP), finanziato dallo SHIC, e la piattaforma analitica PRRS-Loom, è stato lanciato nell'agosto 2025. Il rapporto è concepito per fornire ai produttori-allevatori e ai veterinari un allarme precoce sulle potenziali minacce, migliorando la preparazione e la risposta coordinata in tutto il settore.
Questa iniziativa utilizza lo strumento PRRS-Loom, un modello di apprendimento automatico che analizza 603 basi ORF5 per classificare i virus in base a lignaggio, sottolignaggio e varianti. Queste classificazioni sono combinate con un algoritmo di previsione che prevede se una variante è destinata a espandersi in modo significativo, definito come un aumento superiore al 20% nell'anno successivo, sulla base di dati retrospettivi con un'accuratezza del 77%. Integrato con i dati MSHMP in tempo quasi reale, L'approccio consente al nuovo rapporto di identificare dove sono già presenti varianti specifiche del PRRSV e di stimare il loro potenziale di diffusione più ampia.
Le varianti del PRRSV sono definite come virus strettamente correlati in base alla similarità del gene ORF5, che in genere differiscono meno del 2,5% all'interno di una variante e del 5% dalla variante correlata più prossima. I VUM rappresentano specificamente le varianti del PRRSV-2 circolanti negli Stati Uniti che mostrano indicatori genetici ed epidemiologici di una trasmissione più ampia. Per evidenziare l'urgenza e orientare le risposte, i VUM sono classificati in quattro livelli in base al numero di siti interessati negli ultimi sei mesi:
- Il livello 1 coinvolge fino a 30 siti
- Il livello 2 coinvolge da 31 a 50 siti
- Il livello 3 coinvolge da 51 a 100 siti
- Il livello 4 coinvolge più di 100 siti
I report per i VUM di Livello 2 o superiore includeranno una discussione epidemiologica più approfondita, esaminando sequenze, siti, sistemi e stati interessati. Questi riassunti saranno accompagnati da curve epidemiologiche che mostrano le dinamiche delle varianti nel tempo e da report sulla situazione che forniscono il contesto per la risposta continua del settore. Insieme, questi strumenti offrono alle parti interessate una maggiore consapevolezza della situazione, aiutando veterinari e produttori ad adattare le strategie prima che una variante raggiunga una distribuzione più ampia.
Queste informazioni saranno ampiamente accessibili e incentrate su informazioni utili per i produttori. I report VUM saranno distribuiti ai partecipanti al MSHMP, condivisi nella newsletter elettronica mensile dello SHIC e resi pubblici sia sul sito web del MSHMP che sulla piattaforma PRRS-Loom.
Giovedì 4 settembre 2025/ Swine Health Information Center/ Stati Uniti.
https://www.swinehealth.org
